개정법은 현행법에 명시된 부당해고에 대한 형사벌칙조항을 삭제(단, 산전후휴가기간 및 그 후 30일 동안 해고를 금지하는 조항의 위반에 대하여는 형사처벌조항 존치)하였습니다. 그러나 노동위원회 구제명령의 실효성을 강화하기 위하여 사용자가 지방노동위원회, 또는 중앙노동위원회의 구제명령을 기한 내에 이행하지 아니할 경우(사용자가 행정소송을 제기한 경우 포함) 노동위원회는 2천만원 한도로 1년에 2회, 2년까지 이행강제금을 부과할 수 있도록 하였습니다. 또한 사용자가 확정된 구제명령을 이행하지 않을 경우 노동위원회의 고발이 있는 경우 1년 이하 징역 또는 1천만원 이하의 형사 벌금에 처할 수 있도록 하였습니다.

개정법은 정리해고시 근로자대표에 대한 사전통보기간을 현행 60일에서 50일로 단축하였습니다. 또한 정리해고 후 3년 이내에 사용자가 정리해고된 근로자의 담당업무와 동일한 업무에 근로자를 채용할 경우 해고된 근로자를 우선적으로 고용하도록 재고용의무를 명시하였습니다.

현행법은 근로계약 체결시 근로조건을 명시하도록 규정하고 있으나, 임금에 관해서만 서면으로 명시하도록 하고 있습니다. 그러나 개정법은 서면으로 명시할 근로조건으로 임금 이외에도 ‘근로기준법상의 근로시간, 휴일, 휴가’를 추가하고, 근로자의 요구가 있는 경우 이를 교부할 의무를 명시하고 이를 위반할 경우 500만원 이하의 벌금에 처할 수 있도록 하였습니다.

종전법은 2006. 12. 31.까지만 기업단위 복수노조의 설립을 금지하고 노조전임자에 대한 급여지원을 허용함으로써, 2007년도부터는 기업단위 복수노조를 허용하고 노조전임자에 대한 급여지원을 금지할 예정이었습니다. 그러나 이에 대한 노사 간의 견해 차이가 커서 노사갈등과 산업현장의 혼란이 초래될 수 있다는 판단 하에 개정법은 이를 2009. 12. 31.까지 유예하였습니다(본 유예규정은 2007. 1. 1.부터 시행).

현행법은 단체교섭과 쟁의행위에 관해 노사 당사자 이외의 제3자의 개입을 제한하였으나 개정법은 이러한 제3자 개입의 제한에 관한 규정을 삭제하였습니다.

개정법은 조정제도를 활성화하기 위하여 노동위원회가 분쟁 발생 이전부터 해결 때까지 적극적으로 분쟁 조정서비스를 제공할 수 있는 근거를 마련하였고, 사적조정제도를 활성화하고자 사적조정인, 사적중재인이 수수료, 수당, 여비 등을 받을 수 있는 근거를 마련하였습니다.

현행법은 사업장 안전보호시설의 정상적인 유지, 운영을 정지, 폐지, 방해하는 쟁의행위를 금지하고(위반시 1년이하, 1천만원 이하 벌금), 이를 위반하는 쟁의행위에 대해서는 행정관청이 노동위원회의 의결을 얻어 중지를 명할 수 있도록 하고 있으나(중지명령 위반시 1년 이하 징역 또는 1천만원 이하 벌금), 이는 이중 처벌이라는 지적이 있어 개정법은 중지명령 위반시 벌칙조항을 삭제하였습니다. 또한 개정법은 쟁의행위 찬반투표의 공정성과 투명성 관련 논란을 예방하고자 노조규약에 쟁의행위 찬반투표 결과의 공개, 투표용지 등의 보존 및 열람에 관한 사항을 의무적으로 정하도록 하였습니다.

개정법은 필수공익사업에 대한 노동위원회의 직권중재제도는 폐지하였습니다. 다만, 필수공익사업의 범위에 생명, 신체의 안전 등과 관련된 사업(즉, 혈액공급사업과 항공운수사업)을 추가하였고, 필수공익사업 업무 중 업무가 정지, 폐지될 경우 공중의 생명, 건강, 신체의 안전이나, 공중의 일상생활을 현저히 위태롭게 하는 업무(대통령령을 통해 구체적으로 정함)를 필수유지업무로 정하여 그 정당한 유지, 운영을 정지, 폐지 또는 방해하는 쟁의행위를 금지하였습니다. 또한 필수공익사업에 대해서는 쟁의행위 기간 중에 한하여 파업참가자의 50%를 초과하지 않는 범위 내에서 대체근로를 허용하였습니다.